Desempenho de ferramentas genotípicas na predição de tropismo dos subtipos C e F do HIV-1

O HIV-1 possui um tropismo pelos correceptores CCR5 e/ou CXCR4, necessitando de uma dessas proteínas para infectar a célula. O aparecimento de antagonistas de correceptores renovou o interesse pelo tropismo. O desenvolvimento e o uso clínico destes fármacos trouxeram a necessidade de se conhecer o tropismo no paciente vivendo com HIV. Metodologias para sua predição foram desenvolvidas com base em características fenotípicas ou genotípicas, sendo a maioria baseada em características genéticas do subtipo B do HIV-1. Atualmente, não há um consenso sobre as ferramentas genotípicas a serem usadas para a análise do tropismo em cepas do subtipo C e F do HIV-1, as duas mais frequentes no Brasil após o subtipo B. Assim, o objetivo do estudo foi avaliar o desempenho dos algoritmos genotípicos na predição do uso de correceptores dos subtipos C e F do HIV-1 com fenótipos biológicos conhecidos.

Produção científica:

• SOARES, Rita C. M.; RAPOSO, Letícia M.. Desempenho de ferramentas genotípicas e stacking na predição de tropismo do subtipo C do HIV-1. In: CONCURSO DE TRABALHOS DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA - SIMPÓSIO BRASILEIRO DE COMPUTAÇÃO APLICADA À SAÚDE (SBCAS), 20. , 2020, Evento Online. Anais […]. Porto Alegre: Sociedade Brasileira de Computação, 2020 . p. 99-104. ISSN 2763-8987. DOI: https://doi.org/10.5753/sbcas.2020.11565.